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SEARCH
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Keyword
| : Gene title 조회 |
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ID
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: Gene ID 조회
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Log ratio
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: Log2
scale의 Ratio (Log2
: Cy5 intensity
/ Cy3 intensity)
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Regulation
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:
DEG(Differentially
expressed gene)
정보 검색
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Spot filter
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: User-define된 error
spot들이나 통계적인
error spot들을 제거한뒤
검색
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Functional category
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: Gene ontology
consortium에서 정의한
category에 의한
분류
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SLIDE INFORMATION
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Raw data | : DNA chip raw data 파일
다운로드 |
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Data
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: Time series
data에 대한 정보
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View
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: DNA chip
실험 조건, Samlpe
과 Chip 그리고 Scanning에
대한 정보
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Plots
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: DNA chip상의
Spot들에 대한 QC
plot 정보
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DEGs
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: Differentially
expressed gene으로
추출된 UP / Down
regulated gene list
정보
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SPOT INFORMATION
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Foreground
| : Cy5 / Cy3 Median, Mean,
Standard Deviation
signal
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Background | : Cy5 / Cy3 Median, Mean,
Standard Deviation
signal
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EXPERIMENT RESULTS
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Experession Ratio
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: 각 실험조건 별 Spot의
log ratio 정보.
Mean / Standard
Error
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Blast
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: Spot에
대한 Blastn 검색
결과
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GO
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: Spot에 대한
기능을 Gene ontology
를 이용해 분석
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Gene cluster
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: Chip상에 동일한
기능 category에
속하는 Spot들의
clustering 결과
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Co-experessed
gene
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: Correlation
0.8 이상의 Spot에
대한 정보 [QT-cluster]
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Sequence
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: Spot에
대한 서열
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